STR鉴定:个体识别的精准钥匙
在法医物证学、亲缘关系鉴定、个体身份识别等众多领域,短串联重复序列(Short Tandem Repeat, STR)分析已成为当今最核心、应用最广泛的DNA分型技术。它以其高度的个体特异性、稳定性和检测灵敏度,为精准识别个体身份提供了科学基石。
一、 什么是STR?
- 核心概念: STR是基因组中广泛存在的特定DNA序列。其特点是由2-6个碱基对(bp)组成的核心重复单元(如AGAT, GATA等)串联重复多次构成。例如:
[AGAT]₇
表示AGAT这个序列重复了7次。 - 多态性来源: STR位点的核心价值在于其高度多态性。同一个STR位点,不同个体之间核心单元的重复次数可能存在差异。这种重复次数的差异,就是我们所说的等位基因。例如,一个STR位点可能包含从5次到20次重复的不同等位基因。
- 遗传特性: STR遵循孟德尔遗传定律,具有稳定的遗传模式。子代的每一个STR等位基因必定来自于其生物学父母(父源一个,母源一个)。
二、 STR鉴定技术原理
STR鉴定并非直接测序整个基因组,而是通过扩增和分析多个精心选择的、具有高度多态性的STR位点来实现个体识别。其核心技术流程包括:
- DNA提取: 从各种生物检材(血液、唾液、精斑、组织、毛发根、脱落细胞等)中纯化出高质量的DNA。
- 多重PCR扩增:
- 使用设计好的特异性引物,通过聚合酶链式反应(PCR)技术,同时扩增多个(通常13到20个甚至更多)选定的STR核心位点。
- 引物上通常标记有不同颜色的荧光染料,以便后续区分不同位点的扩增产物。
- 片段大小分离与检测:
- 毛细管电泳 (CE): 这是目前最主流的方法。将扩增产物注入充满高分子聚合物的毛细管中,在高压电场下,不同长度的DNA片段(对应不同重复次数)以不同速度迁移,实现精确分离。
- 检测: 在毛细管末端通过激光激发荧光染料,检测器捕获荧光信号,形成包含片段大小(即重复次数)和荧光强度信息的电泳图谱。
- 基因分型与分析:
- 片段大小确定: 通过与已知大小内标(Ladder)的比对,软件精确计算出每个荧光峰对应的DNA片段大小。
- 等位基因判读: 根据每个STR位点的已知特征(核心序列、重复单元长度),将检测到的片段大小转换为该位点的具体等位基因编号(通常指核心单元的重复次数)。
- 图谱解读: 最终生成一份详细的报告,列出每个被检测STR位点上的两个等位基因(一个来自父本,一个来自母本),形成该样本独特的STR基因型图谱或数据列表。
三、 STR鉴定的核心优势
- 高度个体特异性: 同时检测多个独立的、高度多态性的STR位点,其组合产生的基因型在无关个体间完全相同的概率极其微小(通常低于万亿分之一),足以实现个体水平的精确识别(除同卵双胞胎外)。
- 灵敏度高: PCR技术的指数级扩增特性,使得STR分析能够处理极其微量的DNA样本(甚至低至皮克级)或降解的DNA样本。
- 稳定性好: 在一个个体的不同组织(血液、毛发、肌肉等)中,其STR基因型是高度稳定且一致的(生殖细胞突变除外)。
- 标准化与兼容性强: 国际上建立了标准的STR核心位点复合扩增系统(如早期CODIS核心位点集)。不同实验室使用相同的位点组合和命名规则,保证了检测结果的高度可比性和全球范围内的数据共享。
- 自动化程度高: 从DNA提取到扩增、电泳、分型,均可实现自动化操作,通量高、结果客观、判读标准化,大大提高了效率和可靠性。
四、 STR鉴定的主要应用领域
- 法医物证鉴定:
- 个体识别: 比对现场遗留生物物证(血迹、精斑、唾液斑、脱落细胞等)的STR分型与嫌疑人样本,确定是否为同一人所留。
- 亲缘关系鉴定: 在刑事案件中,通过比对无名尸、骸骨或失踪人员亲属的STR分型,进行身源认定和亲子关系确认。
- 混合斑分析: 解析包含多个个体DNA成分的混合样本(如轮奸案中的精液混合斑)。
- 数据库建设: 建立STR数据库(如国家DNA数据库),用于串并案、查找嫌疑人、确认前科人员身份等。
- 亲缘关系鉴定:
- 亲子鉴定: 确认生物学亲子关系(父-子/女、母-子/女),是法律上亲子关系认定的黄金标准。STR分型符合孟德尔遗传规律,通过比对父母子三者的等位基因传递情况即可做出准确判断。
- 其他亲缘鉴定: 兄弟姐妹关系、祖孙关系、叔侄关系、同胞关系(如双胞胎是同卵还是异卵)、寻亲认亲等。
- 个体身份识别:
- 重大灾难遇难者身份识别。
- 移民身份确认。
- 辅助生殖技术中的胚胎、配子身份核对。
- 其他应用:
- 骨髓/干细胞移植监测: 监测移植后受者体内供者细胞嵌合比例变化。
- 细胞系鉴定(STR细胞鉴定): 验证细胞培养物的身份和是否被交叉污染。
- 遗传病研究(部分动态突变疾病): 某些神经退行性疾病与特定STR位点的异常扩增有关。
五、 技术局限性与新发展
- 局限性:
- 同卵双胞胎区分: 无法区分遗传物质完全相同的同卵双胞胎。
- 近亲干扰: 在亲缘关系鉴定中,尤其是涉及近亲(如堂表兄弟姐妹)参与的复杂亲缘关系鉴定时,存在一定挑战,可能需要分析更多位点或结合其他技术(如SNP)。
- 高度降解或污染样本: 虽然灵敏度高,但严重降解或污染严重的样本仍可能导致分型失败或结果复杂难解。
- 罕见突变: 配子形成过程中的新生突变可能导致亲子鉴定结果偏离预期遗传规律,需结合其他信息判断。
- 新发展:
- 更多位点检测: 增加检测位点数(如扩展至20个以上),进一步提高个体识别能力和复杂亲缘关系分析能力。
- 二代测序技术应用: 基于高通量测序平台的STR分型(MPS-STR)不仅能获得重复次数信息,还能获取核心序列内部的变异信息(如序列多态性),提供更高的分辨率和信息量,特别适用于降解样本和混合样本分析。
- 快速检测平台: 开发小型化、便携式设备,推动现场快速DNA检测。
- DNA表型分析结合: STR识别个体身份的同时,探索结合其他分子标记推断种族地域来源、外貌特征(如虹膜颜色、发色)等表型信息。
结语
STR基因分型技术以其卓越的个体识别能力、稳定性和高效性,深刻地改变了法医学、亲缘关系判定和众多其他需要对个体进行精准识别的领域。其标准化的流程和庞大的数据库支撑,使其成为司法公正和身份确认不可或缺的科学工具。随着科技的不断进步,STR分析与新技术的融合将进一步提升其应用效能和范围,持续为人类社会的身份识别需求提供坚实可靠的科学依据。