志贺氏菌检测:方法与流程详解
一、 志贺氏菌概述
志贺氏菌(Shigella spp.)是引起人类细菌性痢疾(志贺菌病)的主要病原体。该菌属于肠杆菌科,革兰氏阴性杆菌,无芽孢、无荚膜、无鞭毛(无动力)。根据其生化特性和O抗原的不同,主要分为4个血清群(种):
- A群: 痢疾志贺氏菌 (S. dysenteriae),毒力最强,可产生志贺毒素(Shiga toxin),易引起严重疾病甚至溶血性尿毒综合征(HUS)。
- B群: 福氏志贺氏菌 (S. flexneri),在发展中国家最常见。
- C群: 鲍氏志贺氏菌 (S. boydii)。
- D群: 宋内氏志贺氏菌 (S. sonnei),在发达国家最常见,引起的症状通常相对较轻。
志贺氏菌主要通过粪-口途径传播,传染性极强(仅需10-100个菌即可致病)。污染的水源、食物(尤其是生食蔬菜、沙拉、乳制品),以及人与人之间的直接接触是主要传播方式。感染后可引起发热、腹部绞痛、里急后重以及腹泻(便中常带血和粘液)。及时、准确的实验室检测对于病例诊断、疫情调查和防控、食品安全保障以及水源监测至关重要。
二、 样本采集与处理
- 样本类型:
- 临床样本: 新鲜腹泻粪便(首选,采集后尽快送检)、直肠拭子(适用于不便采集粪便者)。
- 食品样本: 可疑受污染的即食食品、生鲜果蔬、乳制品等。需无菌操作采集代表性样本。
- 环境样本: 可疑污染源(如食品加工表面、器具、水源等)的涂抹拭子或水样。
- 采集与运输:
- 使用无菌容器或专用运送培养基(如Cary-Blair运送培养基)。
- 粪便样本量约为1-5克或1-5毫升。
- 样本应在采集后2小时内送达实验室。若不能及时送检,需冷藏(2-8°C),但不超过48小时(某些培养基可能要求更短时间)。冷冻会降低志贺氏菌的存活率,通常不推荐。
- 样本预处理:
- 食品和环境样本通常需要经过特定的前处理(如均质、增菌液的添加)以满足后续检测要求。
三、 主要检测方法
志贺氏菌检测通常采用多种方法组合,以提高检出率和准确性。核心流程包括增菌培养、选择性分离、生化鉴定和血清学鉴定(临床诊断常用)。
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增菌培养
- 目的: 提高样本中可能存在的少量志贺氏菌的数量,抑制杂菌生长。
- 培养基:
- GN增菌肉汤 (Gram Negative Broth): 常用选择性增菌液。
- 志贺氏菌肉汤: 专门设计用于志贺氏菌增菌。
- 方法: 将样本接种到增菌液中,在适宜温度(通常35-37°C)下振荡培养6-24小时(具体时间根据方法和样本类型调整)。
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选择性分离培养
- 目的: 从增菌液或原始样本中分离出志贺氏菌的单个菌落。
- 培养基(常用):
- 木糖赖氨酸去氧胆酸盐琼脂 (XLD Agar): 志贺氏菌菌落呈红色或粉红色(不发酵木糖),中心可能呈黑色(如果产生H2S,但大多数志贺氏菌不产生)。沙门氏菌与之类似但有黑心。
- 麦康凯琼脂 (MacConkey Agar): 志贺氏菌菌落呈无色或淡粉色(不发酵乳糖或迟缓发酵,如宋内氏菌)。
- 沙门志贺琼脂 (SS Agar): 志贺氏菌菌落通常无色透明(有时中心带黑点),乳糖发酵菌呈粉红色。
- Hektoen肠道琼脂 (HE Agar): 志贺氏菌菌落呈蓝色或蓝绿色(不发酵乳糖和蔗糖),沙门氏菌与之类似但常有黑心。
- 方法: 取增菌液或样本悬液划线接种于一种或多种选择性平板,于35-37°C培养18-24小时。观察平板上可疑菌落形态(无色、半透明、光滑、直径约1-3mm)。
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初步筛选与纯化
- 挑取符合志贺氏菌特征的可疑菌落,接种到非选择性琼脂平板(如营养琼脂、胰酪大豆琼脂/TSA)或三糖铁/克氏双糖铁琼脂(TSI/KIA)斜面进行纯化和初步生化筛选。
- 三糖铁琼脂 (TSI) / 克氏双糖铁琼脂 (KIA):
- 志贺氏菌典型反应:斜面碱性(红色)、底层酸性(黄色)、不产气(底部裂隙无气泡)、不产H2S(无黑色)。
- 注意: 宋内氏菌和鲍氏志贺氏菌14型可能迟缓发酵乳糖(几天后底层变黄);某些福氏志贺氏菌6型可产少量气体。
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生化鉴定
- 纯化后的纯菌落需进行一系列生化试验以鉴定到属(肠杆菌科→志贺氏菌属)和种。
- 关键生化特征:
- 氧化酶阴性 (Oxidase -)
- 不发酵乳糖(宋内氏菌和鲍氏菌14型通常迟缓发酵)
- 不发酵蔗糖(某些鲍氏菌株可发酵)
- 不产生赖氨酸脱羧酶 (LDC -)
- 通常不产生鸟氨酸脱羧酶 (ODC -)(宋内氏菌为阳性ODC+,鲍氏菌13型也阳性)
- 不产生H2S (TSI中无黑色)
- 不产生尿素酶 (Urease -)
- 不利用枸橼酸盐 (Citrate -)
- 不运动(无动力)
- 甲基红试验阳性 (MR +),VP试验阴性 (V-P -)
- 方法: 可使用传统生化试验管、微量生化鉴定系统或自动化鉴定仪器进行操作和判读。
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血清学分型
- 目的: 对生化鉴定符合志贺氏菌属的菌株确定其血清群(种)和血清型。这是流行病学调查和溯源的关键。
- 方法: 使用多价和单价志贺氏菌抗血清(A/B/C/D群)进行玻片凝集试验。
- 先用志贺氏菌多价血清(包含A/B/C/D群抗体)进行凝集。
- 若多价凝集阳性,则再用各群单价血清(如抗A群、抗B群…)进行凝集,确定血清群(即种)。
- 在确定血清群后,有时还需用特定的型因子和群因子血清进行凝集,进一步确定血清型(如福氏志贺氏菌分1a, 2a, 3b等型)。宋内氏菌只有一个血清型,但可分光滑型(I相)和粗糙型(II相)。
- 要点: 凝集试验需在生理盐水对照无自凝的基础上进行;需使用新鲜纯培养物;凝集反应应在规定时间内观察;注意交叉反应(如与大肠杆菌O抗原)。
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分子生物学检测
- 原理: 检测志贺氏菌特异的基因片段(如侵袭性质粒抗原H基因 ipaH,该基因在质粒和染色体上均存在,检出率高且稳定;志贺毒素基因 stx 对于痢疾志贺氏菌1型尤为重要)。
- 常用技术:
- 聚合酶链式反应 (PCR): 常规PCR、多重PCR(同时检测志贺氏菌靶基因和其他病原体如沙门氏菌、致病性大肠杆菌基因)、实时荧光定量PCR (qPCR,快速、灵敏度高、可定量)。
- 等温扩增技术 (如LAMP, RPA): 快速、简便,有时无需复杂仪器。
- 优势:
- 速度快(数小时出结果)。
- 灵敏度高,可检测死菌或受抑制的菌。
- 特异性强,能准确区分志贺氏菌和其他近源菌(如侵袭性大肠杆菌EIEC)。
- 可用于直接检测临床粪便标本(需有核酸提取步骤)或增菌液/可疑菌落。
- 局限: 需要专业仪器和操作人员;阳性结果仅表明靶基因存在,不代表有活菌或致病菌存在(需结合培养);成本相对较高;无法直接用于抗菌药物敏感性试验。
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免疫学检测(快速检测)
- 原理: 利用抗体(单抗或多抗)检测志贺氏菌特异抗原(如脂多糖O抗原)。
- 常用方法:
- 酶联免疫吸附试验 (ELISA): 可用于检测样本(粪便、食品增菌液)中的志贺氏菌抗原。灵敏度、自动化程度较高。
- 免疫层析试纸条/侧向流免疫层析 (LFIA): 类似早早孕试纸原理,操作简便、快速(10-30分钟)、无需特殊设备,适用于现场筛查(如基层医疗机构、现场流行病学调查)。
- 优势: 快速、简便。
- 局限: 灵敏度通常低于培养和分子方法;特异性可能受交叉反应影响;多为筛查方法,阳性结果通常需要培养或其他方法确证。
四、 结果报告与解读
- 分离培养+生化+血清学:
- 如分离到菌株,生化符合志贺氏菌属特征,且与志贺氏菌多价及相应单价血清凝集阳性→报告“检出志贺氏菌 [血清群](或具体血清型)”。
- 生化符合志贺氏菌属特征,但血清不凝集→报告“检出志贺氏菌(未分群/未分型)”或“生化鉴定为志贺氏菌,血清凝集阴性”(需进一步研究,可能为罕见血清型或抗原变异)。
- 分子检测(PCR/qPCR):
- 报告特定靶基因(如 ipaH)阳性或阴性。若检测志贺毒素基因(stx),需明确报告。
- 应注明检测的是核酸(DNA),不区分菌的死活。
- 免疫学检测(ELISA/LFIA):
- 报告抗原检测阳性或阴性。通常作为筛查结果,建议备注“阳性结果需经培养确证”。
- 阴性结果: 报告“未检出志贺氏菌”。
五、 质量控制与生物安全
- 质量控制:
- 培养基质控: 使用前检查平板或肉汤是否污染、干裂;定期用标准参考菌株测试其选择性和生长特性。
- 试剂质控: 生化试剂、血清(尤其是新开封或长期未使用的批次)需用已知阳性和阴性菌株进行验证。
- 仪器质控: 自动化仪器按操作规程进行校准和维护。
- 人员与操作: 操作人员需经过培训;严格遵守标准操作规程(SOP)。
- 生物安全:
- 志贺氏菌属于生物安全二级 (BSL-2) 病原体。
- 所有样本处理和细菌培养操作必须在BSL-2实验室中进行。
- 操作人员必须穿戴适当的个人防护装备(PPE),包括实验服、手套、护目镜/面罩(可能产生气溶胶时)。
- 严格遵循良好微生物操作规范(GMP),防止产生气溶胶、避免皮肤和粘膜接触。
- 所有废弃物(培养物、污染材料)必须经过有效灭菌(高压蒸汽灭菌)后才能丢弃。
六、 总结
志贺氏菌检测是诊断细菌性痢疾和识别污染源的核心手段。传统方法(增菌→分离培养→生化鉴定→血清分型)仍是实验室诊断的“金标准”,结果直观可靠,并能获得活菌用于分型、药敏试验和深入研究。分子生物学方法(特别是qPCR)因其快速、高灵敏度和高特异性,在临床快速诊断、疫情应急响应和食品/环境监测中发挥着越来越重要的作用。快速免疫学方法适用于现场初步筛查。现代实验室通常采用多种方法组合的策略,以兼顾速度、准确性和成本效益。严格遵守质量控制程序和生物安全规范是确保检测结果准确可靠、保护实验人员及环境安全的前提。随着技术的进步,未来志贺氏菌检测将朝着更快速、更灵敏、更智能(如自动化、多重检测)以及现场即时检测(POCT)的方向发展。
请注意: 具体的检测规程应严格遵循国家或国际认可的标准方法(如ISO方法、CLSI指南、国家食品安全标准GB方法或国家卫生行业病原检测标准WS方法)。检测方法和流程会随着标准的更新而调整。