墨卓单细胞转录组

墨卓单细胞转录组测序：核心检测项目与技术解析

墨卓生物（MobiDrop）专注于单细胞多组学技术，其单细胞转录组测序解决方案以高通量、高灵活性、操作便捷著称，尤其适合临床样本和复杂组织研究。其核心检测项目围绕单细胞/细胞核RNA测序（scRNA-seq/snRNA-seq），重点在于其独特的微流控平台和配套试剂。

核心检测技术平台：MobiNova系列微流控平台

墨卓的核心是自主研发的微流控芯片系统，提供两种主要模式，满足不同需求：

1. MobiNova-100/200 (芯片式)

   • 原理： 基于微孔阵列芯片。细胞/细胞核被分离到独立的微孔中，结合带有Barcode（细胞标签）和UMI（分子标签）的微磁珠。
   • 特点：
     • 高捕获效率与细胞活性： 温和的流体环境，特别适合脆弱细胞、大细胞（如心肌细胞、卵母细胞）、原代细胞、临床样本。
     • 可控性高： 可精确控制每个孔的反应，兼容固定样本（如FFPE解离核）。
     • 起始细胞数灵活： 从数百个到数万个细胞均可高效捕获。
     • 通量： MobiNova-100 (单芯片，~10,000细胞)， MobiNova-200 (双芯片并行，~20,000细胞)。
     • 兼容性： 可兼容后续的单细胞全长免疫受体测序 (scVDJ-seq) 和 单细胞表面蛋白检测 (如MobiAb-seq)。
   • 适用场景： 珍贵样本、细胞活性要求高、需要高捕获率、固定样本、需要结合蛋白检测或免疫组库分析。

2. MobiCube系列 (液滴式)

   • 原理： 基于微流控油滴包裹技术。细胞/细胞核与带有Barcode和UMI的微磁珠共同包裹在独立的油滴中。
   • 特点：
     • 超高细胞通量： 单次运行可捕获数万至数十万个细胞 (MobiCube R：~20,000； MobiCube S：~80,000； MobiCube X：~200,000)。
     • 高性价比 (大批量)： 适合需要超大细胞数量的项目。
     • 标准化程度高： 自动化程度高，操作流程相对标准化。
   • 适用场景： 需要超大细胞通量的研究（如大型细胞图谱构建、大规模筛选）、样本量充足、追求高性价比的大批量项目。

核心检测流程与关键试剂

墨卓提供从样本制备到数据分析的完整解决方案，关键检测环节和产品包括：

1. 样本制备 (Sample Preparation):

   • 组织解离： 提供优化的组织解离方案和试剂（非专属），确保获得高质量的单细胞悬液。
   • 细胞核分离： 提供针对冷冻组织或FFPE样本的细胞核分离方案和试剂（如MobiNuclei Isolation Kit），是空间转录组和单细胞核测序的基础。
   • 样本保护与冻存： 核心优势！ MobiProtect™ Cell Storage Solution / MobiProtect™ Nuclei Storage Solution 可有效保护细胞/细胞核活性，便于样本常温运输和短期冻存，极大简化了临床样本和跨地域合作的物流难题。

2. 单细胞捕获与文库构建 (Cell Capture & Library Prep):

   • 核心平台： 使用上述MobiNova或MobiCube平台进行细胞/细胞核捕获、裂解、逆转录和cDNA合成。
   • 核心试剂盒： 提供与平台配套的完整试剂盒。
     • MobiNova系列： MobiNova™ Single Cell RNA Kit 等。
     • MobiCube系列： MobiCube™ Single Cell RNA Kit (3’ or 5’) 等。
   • 关键特点： 试剂盒包含所有必要的酶、buffer和带有墨卓专有Barcode/UMI系统的微磁珠，确保高质量文库构建。

3. 建库与测序 (Library Construction & Sequencing):

   • 对平台产生的cDNA进行扩增、片段化、加接头等步骤，构建成标准的NGS测序文库。
   • 墨卓提供或合作提供标准的Illumina平台高通量测序服务。

4. 数据分析 (Data Analysis):

   • 提供基础生物信息学分析服务，包括：
     • 原始数据质控 (FastQC)
     • 序列拆分、比对 (STAR, Cell Ranger)
     • 细胞表达矩阵生成 (UMI计数)
     • 基础分析：细胞质控、归一化、降维聚类 (PCA, t-SNE, UMAP)、细胞类型注释、差异表达分析 (DEGs)、功能富集分析 (GO, KEGG) 等。
   • 也可提供高级分析或与专业生信团队合作。

配套检测产品 (可结合或单独使用)

• MobiAb-seq： 单细胞表面蛋白检测技术，可与scRNA-seq在同一平台上（主要是MobiNova芯片）同时检测RNA和数十种表面蛋白，提供更全面的细胞表型信息。
• MobiDeep Immune： 专注于免疫研究的解决方案，可同时进行scRNA-seq和scVDJ-seq（免疫组库分析），解析免疫细胞的转录组状态及其TCR/BCR克隆型。
• MobiSpatial： 空间转录组学解决方案（需结合Visium或其他空间芯片平台），用于研究基因表达在组织原位空间位置上的分布。

核心应用场景 (检测项目目标)

墨卓单细胞转录组技术广泛应用于生命科学和医学研究的各个领域：

1. 肿瘤研究：
   • 肿瘤异质性解析
   • 肿瘤微环境细胞组成与互作 (TME)
   • 免疫浸润细胞特征与功能状态
   • 耐药机制、复发机制研究
   • 循环肿瘤细胞 (CTC) 分析
2. 免疫学：
   • 免疫细胞图谱构建 (健康 vs 疾病)
   • 免疫细胞发育、分化与激活
   • 自身免疫性疾病机制
   • 感染免疫反应
   • 免疫治疗疗效评估与生物标志物发现 (结合MobiDeep Immune更佳)
3. 发育生物学：
   • 胚胎发育过程中的细胞命运决定
   • 器官发生与细胞谱系追踪
   • 干细胞分化机制
4. 神经科学：
   • 复杂脑组织的细胞类型鉴定 (尤其依赖snRNA-seq)
   • 神经发育与退行性疾病机制 (如阿尔茨海默病、帕金森病)
   • 神经元、胶质细胞的功能状态
5. 基础细胞生物学：
   • 发现新细胞类型/亚群
   • 细胞状态转换 (如上皮-间质转化)
   • 细胞对刺激或扰动的响应
6. 疾病机制与生物标志物：
   • 心血管疾病、代谢性疾病、罕见病等
   • 寻找诊断、预后或治疗响应的潜在生物标志物

总结：墨卓单细胞转录组检测项目的核心优势

• 双模式平台选择： MobiNova (芯片式) 适合珍贵样本、脆弱细胞、高活性要求、固定样本、多组学整合；MobiCube (液滴式) 适合超大通量、高性价比项目。用户可根据需求灵活选择。
• 优异的样本兼容性与保护： MobiProtect™ 系列保护液 解决了临床样本和异地合作中样本运输和保存的核心痛点。
• 国产化与成本优势： 作为国产平台，相比国际巨头，在试剂耗材成本上通常更具竞争力。
• 操作相对便捷： 平台设计考虑了操作的简便性，尤其MobiCube自动化程度较高。
• 多组学整合潜力： MobiNova平台易于整合RNA+蛋白 (MobiAb-seq) 或RNA+免疫组库 (MobiDeep Immune)，提供更全面的单细胞视图。

总而言之，墨卓单细胞转录组检测项目的核心在于其创新的微流控技术平台（MobiNova和MobiCube）以及配套的、特别是解决样本痛点的试剂（如MobiProtect™），为用户在广泛的生物医学研究领域（尤其是临床转化研究）提供了高效、灵活且可靠的解决方案。 选择哪种平台（芯片式 vs 液滴式）是启动项目时最关键的决策点之一，需根据具体样本特性、研究目标和预算来决定。

如需了解特定应用场景的详细方案或技术参数，建议直接咨询墨卓生物技术支持。