华大单细胞转录组学

发布时间:2025-06-03 18:21:17 阅读量:6 作者:生物检测中心

一、华大单细胞转录组学技术平台

平台名称:DNBelab C 系列单细胞测序系统 技术原理:基于微流控芯片(微孔捕获)+ 磁珠标记(DNBSEQ专属标签) 核心优势

  • 国产化平台:摆脱进口设备限制,适配DNBSEQ测序仪
  • 高性价比:较同类平台低30%以上成本
  • 低起始量:支持100-10,000细胞量级样本

二、核心检测项目详解

1. 基础单细胞转录组测序(scRNA-seq)

2. 特色扩展检测

  • 单细胞免疫组库(VDJ)
    • 同步检测TCR/BCR全长序列
    • 支持免疫细胞克隆追踪
  • 空间转录组联合分析
    • 结合Visium芯片实现空间定位
    • 组织微环境解析(如肿瘤边界)
  • ATAC-seq联合测序
    • 表观遗传调控+基因表达多维整合

3. 特殊样本解决方案

三、全流程标准化服务

Mermaid

四、生信分析核心模块

  1. 基础分析
    • 原始数据质控(Q30>85%)
    • 细胞过滤(线粒体基因<20%)
    • PCA/t-SNE/UMAP降维聚类
  2. 高级分析
    • 细胞通讯(CellPhoneDB)
    • 转录因子调控网(SCENIC)
    • 肿瘤克隆进化(CopyKAT)
  3. 定制化挖掘
    • 疾病biomarker筛选
    • 药物靶点预测

五、临床级检测能力(CAP/CLIA认证)

  • 合规性
    • 样本采集SOP符合GLP规范
    • 数据安全加密(符合GDPR)
  • 质控体系
    • 每批次插入标准品对照
    • 批次效应矫正(Harmony算法)

六、标杆案例数据

  • 人胚胎发育图谱

    单批次解析20万细胞,鉴定新型干细胞亚群(Cell, 2022)

  • 肝癌免疫微环境

    联合scRNA+VDJ发现耗竭T细胞克隆(Nature Medicine, 2023)

七、项目设计建议

  1. 样本分组
    • 实验组 vs 对照组 ≥ 3重复
    • 建议每组4-6样本提升统计效力
  2. 测序策略
    • 基础科研:50,000 reads/cell
    • 稀有细胞鉴定:100,000 reads/cell
  3. 成本优化
    • 多组学整合可共享对照样本

八、技术优势对比(vs 10x Genomics)

九、服务周期与交付

  • 标准流程: 样本接收 → 建库测序(15工作日)→ 生信报告(10工作日)
  • 交付内容
    • 原始数据(FASTQ)
    • 细胞-基因表达矩阵
    • PDF/HTML交互式报告

十、适用研究领域

Mermaid

备注:最新平台DNBelab C6已支持百万级细胞通量,适用于大规模细胞图谱计划(如百万细胞计划专项折扣)。建议科研用户在方案设计阶段联系华大技术支持(400-706-6615)获取定制化优化建议。