荧光素酶蛋白互作分析(Split-Luciferase Complementation Assay, Split-LUC)
一、 技术原理
Split-LUC 技术是一种基于生物发光共振能量转移(BRET)原理,用于在活细胞或接近生理环境中实时、灵敏地检测蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction, PPI)的强大工具。其核心策略是将一个完整的报告酶——荧光素酶(Luciferase) ——拆分成两个独立的、本身不具备催化活性或活性极低的功能片段(通常称为 N 端片段 NLuc
和 C 端片段 CLuc
,或根据大小称为 LargeBiT
和 SmallBiT
)。
- 片段化: 荧光素酶(常用的是 萤火虫荧光素酶 或更亮的 纳米荧光素酶)被基因工程改造,在特定位点被切割成两个片段。
- 融合表达: 这两个非功能片段(假设为
NLuc
和CLuc
)分别与待研究的两个潜在相互作用蛋白(Protein A 和 Protein B)进行融合表达,形成融合蛋白:Protein A-NLuc
和Protein B-CLuc
(或反过来)。 - 相互作用诱导互补: 当 Protein A 和 Protein B 在细胞内或体外环境中发生特异性相互作用时,会促使它们各自携带的
NLuc
和CLuc
片段在空间上相互靠近。 - 活性恢复与发光检测: 空间上的接近使得
NLuc
和CLuc
片段能够重新折叠,形成具有完整或接近完整酶活性的荧光素酶结构。此时,加入外源的底物(萤火虫荧光素或呋喃荧光素),恢复活性的荧光素酶即可催化底物发生氧化反应,产生生物发光信号(光子)。发光信号的强度与 Protein A 和 Protein B 相互作用的强度和发生相互作用的分子数量成正比。
二、 实验流程(典型活细胞检测)
-
载体构建:
- 将目标蛋白 A 的基因克隆到含有一个荧光素酶片段(如
NLuc
)的表达载体中。 - 将目标蛋白 B 的基因克隆到含有互补荧光素酶片段(如
CLuc
)的表达载体中。 - 构建阴性对照:例如,将
NLuc
和CLuc
片段分别与已知不相互作用的蛋白(或空标签)融合,或将其中一个目标蛋白替换为已知不相互作用的突变体/无关蛋白。 - 构建阳性对照(可选但推荐):使用已知强相互作用的蛋白对(如 Fos/Jun)连接到相同的 Split-LUC 系统中。
- 将目标蛋白 A 的基因克隆到含有一个荧光素酶片段(如
-
细胞转染/转导:
- 将构建好的两组融合蛋白表达载体(
Protein A-NLuc
+Protein B-CLuc
)共转染到合适的哺乳动物细胞、植物原生质体或其他细胞类型中。也可使用病毒载体进行稳定转导。 - 同时转染阴性对照和阳性对照。
- 将构建好的两组融合蛋白表达载体(
-
培养与处理:
- 细胞在适宜条件下培养,使融合蛋白得以表达。
- 若研究诱导型相互作用或药物处理效应,可在此时加入特定的刺激物、抑制剂或药物。
-
发光检测:
- 底物添加: 向细胞培养体系中加入荧光素酶底物溶液(通常含有荧光素、ATP、Mg²⁺等必需成分)。对于纳米荧光素酶(NanoLuc),使用的是呋喃荧光素(Furimazine)或其优化衍生物(如 EnduRen™、Viviren™等),它们具有更好的细胞渗透性和稳定性,尤其适合长时间动力学监测。
- 信号读取: 使用化学发光检测仪(如酶标仪配备化学发光模块、活体成像系统或发光计)实时或终点法测量产生的生物发光信号(通常以相对发光单位 RLU 表示)。
- 检测模式:
- 终点法: 在特定时间点(如转染后 24-48 小时)加底物并立即读数。
- 动力学监测: 连续或间隔读取发光信号,观察相互作用随时间或处理条件的变化。
-
数据分析:
- 比较实验组(
Protein A-NLuc + Protein B-CLuc
)与阴性对照组的发光信号。显著高于阴性对照的信号表明 Protein A 和 Protein B 存在相互作用。 - 通常会将发光信号归一化(如除以共转染的荧光蛋白表达量来校正转染效率差异)。
- 计算信噪比(实验组 RLU / 阴性对照 RLU)或进行统计学分析(如 t 检验、ANOVA)。
- 比较实验组(
三、 技术优势
- 高灵敏度: 荧光素酶催化反应产生的光信号背景极低,使其具有极高的检测灵敏度,能检测到微弱或瞬时的相互作用。
- 实时动态监测: 尤其在使用稳定性好的底物(如 EnduRen™)时,可在活细胞内对 PPIs 进行长时间、非侵入性的实时监测,研究相互作用的动力学过程(如信号传导、药物作用)。
- 生理相关性: 主要在活细胞内进行,蛋白质在接近其天然环境(包括正确的亚细胞定位、翻译后修饰、辅助因子)下表达和相互作用,结果更具生理意义。
- 低背景/高信噪比: 非相互作用的片段通常无法互补产生有效发光,背景信号低。
- 适用于多种样本: 不仅可用于培养细胞,还可扩展到植物组织、模式生物(如线虫、斑马鱼、小鼠活体成像)以及体外纯化的蛋白样品。
- 信号放大效应: 一个酶分子可催化多个底物分子反应产生大量光子,具有信号放大作用。
- 定量化: 发光强度通常与相互作用的蛋白复合物量成正比,可进行半定量或定量分析。
- 通量潜力: 适用于 96 孔板或 384 孔板形式,可用于中等通量的药物筛选(寻找 PPI 抑制剂/激动剂)。
四、 技术局限性与注意事项
- 间接检测: 检测的是荧光素酶片段互补后产生的发光信号,而非相互作用本身。需要谨慎排除假阳性和假阴性。
- 片段大小与融合位置: 荧光素酶片段的大小及其与目标蛋白融合的位置(N端或C端)可能影响目标蛋白的结构、功能、定位以及相互作用能力。通常需要优化融合策略(不同末端、添加柔性连接肽)。
- 空间位阻: 如果相互作用界面靠近融合位点,荧光素酶片段的空间位阻可能阻碍互补或影响目标蛋白的相互作用。
- 表达水平与平衡: 两个融合蛋白的表达水平不平衡可能影响互补效率和信号强度。需优化转染比例或使用双顺反子载体。
- 假阳性:
- 非特异性聚集: 片段过表达可能导致非特异性的聚集和互补。
- 随机碰撞: 在高浓度下,即使没有特异相互作用,片段也可能因随机碰撞发生瞬时互补产生背景信号。良好的阴性对照至关重要。
- 假阴性:
- 融合破坏了目标蛋白的结构、定位或相互作用界面。
- 相互作用较弱或瞬时。
- 片段互补效率低(互补位点设计不佳)。
- 底物成本: 优质的商业化底物(尤其适用于活细胞长时间成像的)成本可能较高。
- 仪器依赖: 需要化学发光检测设备。
五、 应用领域
Split-LUC 技术因其独特的优势,在生命科学研究中广泛应用:
- 验证已知或候选 PPIs: 在活细胞环境中验证通过酵母双杂交、生物信息学预测等方法发现的相互作用。
- 绘制相互作用结构域/关键残基: 通过构建目标蛋白的截短体或点突变体融合片段,研究相互作用所需的结构域或关键氨基酸残基。
- 研究信号通路: 实时监测信号传导过程中关键蛋白(如受体-配体、激酶-底物、适配体蛋白之间)相互作用的动力学变化。
- 药物筛选与发现:
- 筛选靶向特定 PPI 的小分子抑制剂(降低发光信号)。
- 筛选 PPI 稳定剂或激动剂(增强发光信号)。
- 评估药物对通路中关键节点相互作用的调控作用。
- 蛋白折叠与功能研究: 利用片段互补研究蛋白折叠、构象变化或分子伴侣功能。
- 膜蛋白相互作用研究: 相比于酵母双杂交,Split-LUC 更适用于研究位于膜上(如 GPCRs)的蛋白相互作用。
- 活体成像: 利用报告基因特性,在模式生物体内可视化特定细胞类型或组织中发生的 PPIs。
六、 发展
Split-LUC 技术仍在不断发展中:
- 优化片段: 开发更小、互补效率更高、背景更低的新型荧光素酶片段(如 NanoBiT™ 系统基于 NanoLuc 的
LargeBiT
和SmallBiT
)。 - 多功能报告系统: 与其他技术(如荧光蛋白 FRET、Split-TEV)结合,实现多重检测或级联反应。
- 临近诱导(Induced Proximity)应用: 基于 Split-LUC 原理发展新型生物传感器,如检测第二信使(cAMP, Ca²⁺)、蛋白酶活性等。
- 三重片段互补系统: 用于研究三元复合物的形成。
总结:
Split-LUC 是一种强大且灵敏的工具,为在活细胞及生理相关环境中研究蛋白质-蛋白质相互作用提供了实时、定量的解决方案。尽管存在一些局限性,但其高灵敏度、低背景、实时动态监测能力以及对生理环境的适应性,使其在基础研究(如信号通路解析、蛋白功能研究)和应用研究(如药物靶点验证和高通量药物筛选)中都具有不可替代的价值。精心设计的实验方案、严格的对照设置以及对结果谨慎的解释是成功应用该技术的关键。